Captarea intrată în funcțiune trebuie lăsată să funcționeze continuu fără variații mari ale debitului.
Când debitul captării trebuie redus,se va reduce debitul la toate puțurile și nu vor fi scoase din funcțiune unele puțuri.Acest lucru se realizează mai ușor la captarea cu sifonare prin închiderea parțială a vanelor de sectorizare de pe colectorul general sau pur și simplu prin reducerea debitului pompat,având grijă ca ultimul puț să nu aibă un debit mult mai redus decât celelalte.
Dacă reducerea de debit este importantă și de lungă durată se poate recurge la oprirea unor puțuri alese nu succesiv.Oprirea se face prin închiderea vanei,lent și apoi oprirea pompei.La repunerea în funcțiune se procedează ca la darea în funcțiune.Oprirea unor puțuri trebuie coordonată și cu operațiile de întreținere sau reparare a pompelor.
La oprirea puțurilor trebuie urmărită cu deosebită atenție comportarea stratului de apă și schimbarea calitativă a apei.Se cunosc cazuri când prin oprire puțurile s-au blocat prin colmatare cu produse de coroziune sau apa și-a schimbat calitatea(a crescut conținutul în substanțe organice)într-un asemenea grad încât captarea nu a mai putut fi folosită.